Il Consiglio d'Amministrazione dell'ARER è costituito con decreto del Presidente della Regione Autonoma della Valle d'Aosta ed è così composto:
- da n. 3 rappresentanti della Regione designati dalla Giunta regionale, fra i quali sono nominati il Presidente e il Vice Presidente;
- da n. 1 rappresentante del Comune di Aosta nominato con decreto del Sindaco;
- da n. 1 rappresentante degli altri enti locali designato dal Consiglio Permanente degli Enti Locali (CPEL).
Il Consiglio d'Amministrazione dura in carica cinque anni ed è rinnovato ad ogni rinnovo del Consiglio regionale.